Biblioteka seminarium została zorganizowana na podstawie księgozbioru biblioteki dekanalnej kościoła Bożego Ciała w Elblągu. Obecnie zbiory biblioteczne wynoszą 27000 woluminów. Biblioteka należy do Federacji Bibliotek Kościelnych "FIDES". Obecnie wdrażany jest w niej system komputerowy.
Wyższe Seminarium Duchowne w Elblągu - katolicka uczelnia wyższa z siedzibą w Elblągu.
W roku 1999 alumni elbląskiego Seminarium, przygotowywali liturgię z okazji przyjazdu do Elbląga papieża Jana Pawła II.
Od początku funkcjonowania, Seminarium, chcąc dać alumnom wykształcenie akademickie, na poziomie studiów magisterskich, współpracowało z Akademią Teologii Katolickiej w Warszawie, która trwała do 1999 roku. W 1999, w nowo powstałym Uniwersytecie Warmińsko-Mazurskim w Olsztynie utworzono Wydział Teologii. W 2000 roku, Biskup elbląski, podpisał umowę o współpracy z władzami uniwersytetu. W ten sposób, elbląscy alumni, z początkiem roku akademickiego 2000/01, stali się studentami UW-M, studiującymi na tamtejszym Wydziale Teologii.
W połowie 1993 roku, diecezja weszła w posiadanie budynków zespołu fabrycznego. Biskup Andrzej Śliwiński podczas święceń kapłańskich alumnów, zadecydował z nimi o przeniesieniu się ich do nowo pozyskanych budynków. Tym samym, w roku akademickim 1993/94 alumni kształcili się już w Elblągu, a nie jak dotychczas, w Seminarium w Olsztynie. Od 1999 roku Seminarium wydaje własny rocznik naukowy Studia Elbląskie. Alumni wydają także własne czasopismo studenckie Myślnik klerycki.
Seminarum zostało erygowane 1 października 1993 roku przez biskupa diecezji elbląskiej Andrzeja Śliwińskiego. Jurysdykcję kanoniczną nad Seminarium sprawuje Biskup elbląski.